6-11歲兒童第2劑莫德納，如符合接種時間間隔，6／18起，家長可帶兒童至本縣COVID-19疫苗合約醫療院所施打，提醒家長須先填寫同意書，也可於各合約院所現場索取，並持健保卡、疫苗接種紀錄卡(黃卡)前往接種，相關疫苗接種服務可至本縣衛生局網站新冠肺炎專區－疫苗地圖查詢，網址：https://ylshb.yunlin.gov.tw/cp.aspx?n=14224。
兒童疫苗2劑間隔從12週縮短為4週以上，根據中央諮詢專家指出，目前因無兒童混打疫苗的安全性報告，除非第1劑接種後出現嚴重不良反應等特殊情形，建議應以同廠牌疫苗完成2劑接種，還有家長擔心兒童接種後可能的心肌炎或心包膜炎，出現的機率遠低於預期，呼籲家長盡快讓兒童完整接種，早打早保護。
兒童接種後局部疼痛、疲倦、頭痛、發燒，為常見的副作用：可多喝水、休息並視需要就醫。如有發燒、感冒、對疫苗成分有嚴重過敏反應史者，則不建議接種。再次呼籲，施打疫苗可降低兒童染疫併發MIS-C的發生率，縮短長新冠症狀時間，不論是大人或小孩，符合接種資格者，有疫苗就打。
統計5/2至6/17，本縣6-11歲兒童莫德納疫苗累計已完成10,905人接種（醫療院所接種7,235人、校園接種3,670人），目前無接種疫苗後不良反應通報。
統計5/25至6/17，本縣5-11歲BNT兒童疫苗累計已完成19,711人接種（醫療院所接種7,276人、校園接種12,435人），目前無接種疫苗後不良反應通報，兒童（莫德納與BNT）COVID-19疫苗總計接種30,616人。
本縣國高中學生校園集中接種BNT疫苗追加劑時程，配合追加劑(第3劑)與第2劑須間隔至少5個月，目前縣府教育處陸續安排各校接種中，將於6月30日前完成，各校安排日程可洽學校，並公告於本縣教育網防疫專區。
南部縣市仍處於疫情高原期，尤其幼童及年長者務必完整接種疫苗，才能真正降低染疫風險及重症發生。
本縣疫情分析
本縣今日新增1491例本土個案中，有682位男性與809位女性，年齡分布在未滿1-99歲，無症狀1238人，輕症253人（以咳嗽、喉嚨痛、發燒為主要症狀）。本縣今日新增8例死亡確診個案，分別為3名男性及5名女性，年齡介於50至90多歲間，有糖尿病、高血壓、心血管疾病、慢性腎病、失智等慢性病史，其中2位已完整接種COVID-19疫苗，1位已接種2劑疫苗，1位已接種1劑疫苗，其餘4位未曾接種疫苗，死亡日期介於6/11至6/14（6/18疾管署判定公告）。
本縣111年1月1日統計至今（6/18），本土累計確診數共49,908例，其中累計94例死亡。綜觀今年本土個案中，其中比例最多的年齡區間為30-39歲共8,110人，佔比約為16.5％；次多的年齡區間為40-49歲共7,720人，佔比約為15.8％；另65歲以上長者共6,603人，占比約為13.5％；0－12歲本縣兒童確診個案數分析如下，國小6－12歲共4,088人，約佔8.3％；學齡前3－6歲共1,760人，約佔3.6％；小於3歲共1,384人，約佔2.8％。
截至6/18，本縣接觸者居家隔離尚在追蹤中有1,260人，輕症居家照護在管中有7,517人，醫療關懷諮詢累計已服務220,888人次，健康益友APP遠距看診註冊有9,533 人，運用健康益友APP視訊診療人數共有151人。社團法人雲林縣藥師公會和社區藥局持續提供居家照護送藥到府服務，並進行用藥指導，自4月25日至6月17日，共計已服務1,446件。