中央宣布為降低社區式照顧機構群聚感染風險，自6月27日起至7月31日止，社區式照顧機構需定期公費快篩，服務對象每週定期快篩2次（2至18歲則每週1次，未滿2歲免篩）；另工作人員每週至少1次，已確診康復者則3個月內免篩檢。
為避免社區中之失能者因罹病危及其生命安全，並降低社區式照顧機構群聚感染風險，除既有住宿型機構外，擴大篩檢措施至社區式機構，並將提供社區式照顧型機構定期快篩之公費試劑，照顧較多慢性病及重症高風險族群的社區式長照機構（日間照顧中心、家庭托顧），也包括附設於各類住宿式機構之日間照顧服務、日間型精神復健機構、身心障礙社區式服務單位、早期療育機構以及托嬰中心等；公費試劑配送數量以服務對象每人10劑及工作人員每人5劑估算，並將直接配送至上述照顧型機構及單位。
目前疫情仍於社區廣泛流行，除定期篩檢外，各照顧機構發現服務對象或工作人員有症狀時，也應進行快篩（未滿2歲有症狀則採PCR）；若篩出陽性個案，則應立即請專責醫療院所完成醫師診斷確診進行通報、評估是否適用抗病毒藥物或視病情開立其他相關藥物，各照顧機構同步提供個案及家屬正確衛教及領藥資訊，並協助服務對象依指示返家居家照護、至集中檢疫所隔離照護或送醫治療。
統計5/2至6/25，本縣6-11歲第1劑兒童莫德納疫苗累計已完成10,785人接種（醫療院所接種7,106人、校園接種3,679人），第2劑累計已完成2,411人接種（醫療院所接種2,311人、校園接種100人），目前無接種疫苗後不良反應通報。
統計5/25至6/25，本縣5-11歲第1劑BNT兒童疫苗累計已完成19,939人接種（醫療院所接種7,504人、校園接種12,435人），第2劑累計已完成159人接種（全在醫療院所接種），目前無接種疫苗後不良反應通報。
完整接種COVID-19疫苗，可有效降低感染後重症、死亡的風險。有意接種的鄉親，請持健保卡、疫苗接種紀錄卡（黃卡）前往本縣COVID-19疫苗合約醫療院所接種，相關接種服務資訊可上網至本縣衛生局網站→新冠肺炎專區→疫苗地圖（網址：https://ylshb.yunlin.gov.tw/cp.aspx?n=14224）查詢。
本縣疫情分析：
本縣今日新增1091例本土個案，分別為518位男性與573位女性，年齡分布在未滿1歲-97歲，無症狀921人，輕症170人（以咳嗽、喉嚨痛、發燒為主要症狀）。今日新增2例境外移入個案。
本縣111年1月1日統計至今（6/26），本土累計確診數共59,532例，其中累計136例死亡。綜觀今年本土個案中，其中比例最多的年齡區間為30-39歲共9,713人，佔比約為16.3％；次多的年齡區間為40-49歲共9,420人，佔比約為15.8％；另65歲以上長者共8,275人，占比約為13.9％；0－12歲本縣兒童確診個案數分析如下，國小6－12歲共4,934人，約佔8.3％；學齡前3－6歲共2,096人，約佔3.5％；小於3歲共1,701人，約佔2.9％。本縣今日新增7例死亡確診個案，分別是3位男性與4位女性，年齡介於30至90多歲間，分別有癲癇、高血壓、糖尿病、慢性阻塞性肺病、中風、失智等慢性病史，其中4位已完整接種COVID-19疫苗，1位已接種2劑疫苗，1位已接種1劑疫苗，另1位未曾接種疫苗，死亡日期介於6/20至6/22。（6/26疾管署判定公告）
截至6/26，本縣接觸者居家隔離追蹤中有1,016人，確診者輕症居家照護在管中有7,223人，醫療關懷諮詢累計已服務296,675人次，健康益友APP遠距看診註冊有10,474 人，運用健康益友APP視訊診療人數共有160人。社團法人雲林縣藥師公會和社區藥局自4月25日至6月25日，持續提供居家照護送藥到府服務，並進行用藥指導，共計已服務2,394件。