本縣公費流感疫苗，配合中央政策分兩階段開打，第一階段「65歲以上長者」、「滿6個月以上至國小入學前幼兒」及「高風險慢性病人」等對象，已於10月1日開打，第二階段對象「50至64歲無高風險慢性病成人」將自11月1日開打，本縣轄內各鄉鎮市皆有合約院所及衛生所可提供公費流感疫苗接種服務，呼籲符合公費接種資格鄉親於開打後儘速預約接種，且亦可與COVID-19疫苗同時接種，兩種疫苗可同一天施打在不同手臂。
衛生局表示，接種流感疫苗是預防流感最有效的方式，近期國內社區流感病毒活動度上升，以A型流感為主，加以目前社區仍為新冠肺炎流行期間，呼籲鄉親盡速預約接種，以期於流感疫情達高峰前獲得足夠保護力，且可與COVID-19疫苗同時接種，請鄉親平時維持良好衛生習慣，倘若出現類流感症狀儘速戴口罩就醫，並在家休息，減少病毒傳播機會，以降低流感與新冠肺炎雙重衝擊。
衛生局提醒，接種流感疫苗後可減少流感病毒的感染風險和降低重症機率，請符合公費接種資格的鄉親儘速預約接種，且可與COVID-19疫苗同時接種。鄉親可先透過本縣衛生局衛生局網頁→重點工作→疾病管制專區→流感及肺鏈疫苗專區（網址：https://ylshb.yunlin.gov.tw/News_Content.aspx?n=5478&s=393324），查詢鄰近合約院所，再電洽醫療院所預約，前往接種時應攜帶健保卡及相關證明文件（如兒童健康手冊、孕婦健康手冊等）。
中央宣布Moderna雙價疫苗（原型株+BA.1），自11月1日起，提供12-17歲青少年接種追加劑使用（包含尚未接種追加劑及已完成單價疫苗追加劑接種者）。追加劑接種間隔調整為至少3個月（12週，84天）以上。
衛生局提醒，鄉親若已接種COVID-19疫苗追加劑（第三劑）滿12週，建議儘速安排時間接種第二次追加劑（第四劑）。本縣轄內「COVID-19疫苗合約醫療院所」，除平日提供接種服務外，部分診所也提供夜診及假日接種，請鄉親先電洽COVID-19疫苗合約醫療院所預約，再依約定時間並攜帶健保卡、疫苗接種紀錄卡（黃卡）前往接種，同時請佩戴口罩、適度保持社交安全距離及執行手部衛生等措施，相關接種服務資訊可上網至雲林縣衛生局網站→新冠肺炎專區→疫苗地圖（網址：https://ylshb.yunlin.gov.tw/News.aspx?n=15251&sms=18466）查詢。
本縣疫情分析：
本縣今日新增473例本土確診個案，分別為223位男性與250位女性，年齡分布在未滿1歲-92歲，無症狀419人，輕症以咳嗽、喉嚨痛、流鼻水、發燒為主要症狀。
本縣111年1月1日統計至今（10/31），本土累計確診數共151,971例，其中累計393例死亡。綜觀今年本土個案中，其中比例最多的年齡區間為40-49歲共23,930人，比例約為15.75％；次多為30-39歲共23,247人，比例約為15.30％；另65歲以上長者共21,134人，比例約為13.91％。
本縣今日新增3例死亡確診個案，分別為2位男性與1位女性，年齡介於70多歲至80多歲，有高血壓、糖尿病、心血管疾病、中風、腎臟疾病、慢性阻塞性肺病、癌症等慢性病史，3位皆已接種2劑COVID-19疫苗，死亡時間介於10/19至10/26。（10/31疾管署判定公告）。
本縣接觸者居家隔離尚在追蹤中有562人，確診者輕症居家照護在管中有4,171人，醫療關懷諮詢累計已服務754,921人次。社團法人雲林縣藥師公會和社區藥局自4月25日至10月30日，持續提供居家照護送藥到府服務，並進行用藥指導，共計已服務5,234件。
衛生局呼籲，請鄉親千萬不要防疫疲乏，仍要持續遵守政府各項防疫措施，並維持個人衛生好習慣，勤洗手、戴口罩、完整接種疫苗、保持社交距離，減少不必要移動、活動或集會，避免出入人多擁擠場所或高感染傳播風險場域，出入公共場域落實手部消毒、體溫量測等相關措施，下載並使用「臺灣社交距離APP」，一起守護鄉親健康。