國內新冠肺炎疫情逐漸趨緩，但台灣5至10月為日本腦炎流行季，其中6至7月為流行高峰，本縣新增1例日本腦炎本土確診個案，時序已進入日本腦炎流行高峰，提醒鄉親應加強居家環境孳生源清除與個人防蚊措施。
夏天是日本腦炎流行期，在台灣以三斑家蚊、環紋家蚊及白頭家蚊為主要病媒蚊，喜歡孶生於水田、灌溉溝渠、池塘、草地積水、大型容器等，吸血高峰期為黃昏與黎明時段，請鄉親盡量避免於病媒蚊吸血高峰時段，或是在易孳生病媒蚊的高風險環境附近活動；如果無法避免，應穿著淺色長袖衣褲保護，並於身體裸露處使用政府機關核可，含敵避(DEET)、派卡瑞丁(Picaridin)或伊默克(IR3535)成分的防蚊藥劑。平時應注意居家環境衛生，落實「巡、倒、清、刷」，不留下積水，做好病媒蚊孳生源清除工作，可使用捕蚊燈、加裝紗窗紗門，睡覺時掛蚊帳等防疫措施，避免蚊蟲孳生叮咬，降低日本腦炎的感染風險。
大部分的人感染日本腦炎後大多無明顯症狀，少數會有頭痛、發燒或無菌性腦膜炎，嚴重則可能出現意識改變、對人時地不能辨別、全身無力、腦神經功能損傷、輕癱等，甚至昏迷或死亡。預防日本腦炎最有效的方法是接種日本腦炎疫苗，滿15個月以上的幼兒，應依接種期程完成日本腦炎疫苗接種，另提醒，於民國56年12月31日(含)以前出生，未接種疫苗的鄉親及新住民，如自覺有感染風險(如養豬戶業者)，可前往國立臺灣大學醫學院附設醫院雲林分院旅遊醫學門診評估是否自費接種日本腦炎疫苗。
統計7/8至7/11，本縣18歲以上Novavax疫苗累計已完成263人接種。統計至7/11，本縣5-11歲兒童已31,022人完成COVID-19疫苗第1劑接種，第2劑已19,214人完成接種，目前無接種疫苗後不良反應通報。
本縣疫情分析：
本縣今日新增1003例本土個案，分別為469位男性與534位女性，年齡分布在未滿1歲-101歲，無症狀871人，輕症以咳嗽、喉嚨痛、發燒為主要症狀。
本縣111年1月1日統計至今（7/12），本土累計確診數共73,718例，其中累計214例死亡。綜觀今年本土個案中，其中比例最多的年齡區間為30-39歲共11,888人，佔比約為16.1％；次多為40-49歲共11,677人，佔比約為15.8％；另65歲以上長者共10,524人，占比約為14.3％；0－12歲本縣兒童確診個案數分析如下，國小6－12歲共6,127人，約佔8.3％；學齡前3－6歲共2,757人，約佔3.7％；小於3歲共2,212人，約佔3％。
本縣今日新增1例死亡確診個案，該案為80多歲女性，有高血壓、失智、腎臟疾病等慢性病史，已完整接種COVID-19疫苗，死亡日期為7/8。（7/12疾管署判定公告）
截至今(7/12)日早上10點為止，本縣接觸者居家隔離尚在追蹤中有761人，確診者輕症居家照護在管中有3,877人，醫療關懷諮詢累計已服務381,289人次，健康益友APP遠距看診註冊有11,915人，運用健康益友APP視訊診療人數共有165人。社團法人雲林縣藥師公會和社區藥局自4月25日至7月11日，持續提供居家照護送藥到府服務，並進行用藥指導，共計已服務3,184件。