同時接種新冠疫苗和流感疫苗並不影響兩種疫苗之免疫原性與安全性，即使幼童及長者也可以放心接種。流感疫苗的保護力約持續1年，且由於流感病毒的變異性極大，幾乎每年均會發生變異，原施打疫苗對不同抗原型之病毒並不具免疫力，致保護效果減低，即使病毒未發生變異，疫苗成分相同，其保護效果亦約只能維持1年，因此建議每年均須接種1次。 愈來愈多證據顯示，同時感染新冠和流感病毒會增加嚴重併發症和死亡率，而接種流感疫苗可以降低感染流感引起重症風險及住院機率，減輕疫情期間對醫療系統的負擔。世界衞生組織 (WHO)建議兩種疫苗可於不同身體部位接種，例如左右手臂各打一針。民眾可按意願同時或分開接種。由於接種疫苗後身體約需2週才能產生抗體，縣長張麗善鼓勵鄉親把握接種時機，儘早於10月接種疫苗，以確保身體有足夠抗體抵禦冬季流感及新冠肺炎。
本縣疫情分析：
本縣今日新增956例本土確診個案，分別為452位男性與504位女性，年齡分布在未滿1歲-96歲，無症狀878人，輕症以咳嗽、喉嚨痛、流鼻水、發燒為主要症狀。
本縣111年1月1日統計至今（10/16），本土累計確診數共140,134例，其中累計365例死亡。綜觀今年本土個案中，其中比例最多的年齡區間為40-49歲共22,160人，比例約為15.81％；次多為30-39歲共21,657人，比例約為15.45％；另65歲以上長者共19,398人，比例約為13.84％。 本縣今日公告新增2例死亡確診個案，1例男性，1例女性，年齡介於50多歲至70多歲間，患有慢性腎臟病、高血脂症、高血壓、慢性B型肝炎、下咽癌和貧血等疾病史，1位已施打4劑疫苗，另1位則施打2劑疫苗，死亡日期 介於 10/11 至 10/12 間。（10/16 疾管署判定公告）。
本縣接觸者居家隔離尚在追蹤中有733人，確診者輕症居家照護在管中有5,831人，醫療關懷諮詢累計已服務694,065人次。社團法人雲林縣藥師公會和社區藥局自4月25日至10月15日，持續提供居家照護送藥到府服務，並進行用藥指導，共計已服務5,012件。
衛生局呼籲，疫情尚屬高原期，請鄉親仍要持續遵守政府各項防疫措施，並維持個人衛生好習慣，勤洗手、戴口罩、完整接種疫苗、保持社交距離，減少不必要移動、活動或
集會，避免出入人多擁擠場所或高感染傳播風險場域，出入公共場域落實手部消毒、體溫量測等相關措施，下載並使用「臺灣社交距離APP」，一起守護鄉親健康。
另提醒各年齡層符合COVID-19疫苗接種資格而尚未接種之鄉親，接種後確實可降低感染後重症、住院及死亡風險，請儘速完成建議接種劑次。本縣轄內「COVID-19疫苗合約醫療院所」，除平日提供接種服務外，部分診所也提供夜診及假日接種，請鄉親先電洽COVID-19疫苗合約醫療院所預約，再依約定時間並攜帶健保卡、疫苗接種紀錄卡（黃卡）前往接種，同時請佩戴口罩、適度保持社交安全距離及執行手部衛生等措施，相關接種服務資訊可上網至雲林縣衛生局網站→新冠肺炎專區→疫苗地圖（網址： https://ylshb.yunlin.gov.tw/News.aspx?n=15251&sms=18466）查詢。