因應Omicron亞型變異株BA.5及其他新興變異株病毒持續在全球擴散，鑑於我國邊境逐步開放，考量住宿式機構照顧較多慢性病及重症高風險族群的長者，應維持警惕避免發生機構群聚感染風險。因此，中央流行疫情指揮中心於10月19日宣布，各類型住宿式及社區式照顧機構需定期公費快篩之措施，再延長1個月至今(2022)年11月30日止，篩檢頻率仍維持為服務對象每週定期快篩2次(身心障礙者、失智症者、2至18歲則每週1次，未滿2歲免篩)，工作人員每週至少1次，已確診康復者3個月內免篩檢，後續再視疫情狀況調整篩檢頻率。
發放對象為住宿式長照機構、老人福利機構、身心障礙福利機構、精神復健機構、一般及精神護理之家、兒少安置機構、兒少團體家庭、榮譽國民之家等住宿型照顧機構，以及日間照顧中心、家庭托顧、身心障礙社區式照顧服務、早期療育機構以及托嬰中心等社區型照顧機構。
提醒各年齡層符合COVID-19疫苗接種資格而尚未接種之鄉親，接種後確實可降低感染後重症、住院及死亡風險，請儘速完成建議接種劑次。本縣轄內「COVID-19疫苗合約醫療院所」，除平日提供接種服務外，部分診所也提供夜診及假日接種，請鄉親先電洽COVID-19疫苗合約醫療院所預約，再依約定時間並攜帶健保卡、疫苗接種紀錄卡（黃卡）前往接種，同時請佩戴口罩、適度保持社交安全距離及執行手部衛生等措施，相關接種服務資訊可上網至雲林縣衛生局網站→新冠肺炎專區→疫苗地圖（網址：https://ylshb.yunlin.gov.tw/News.aspx?n=15251&sms=18466）查詢。
本縣疫情分析：
本縣今日新增849例本土確診個案，分別為371位男性與478位女性，年齡分布在未滿1歲-96歲，無症狀755人，輕症以咳嗽、喉嚨痛、流鼻水、發燒為主要症狀。
本縣111年1月1日統計至今（10/21），本土累計確診數共144,481例，其中累計370例死亡。綜觀今年本土個案中，其中比例最多的年齡區間為40-49歲共22,800人，比例約為15.78％；次多為30-39歲共22,269人，比例約為15.41％；另65歲以上長者共20,039人，比例約為13.87％。
本縣今日新增2例死亡確診個案，分別為1位男性與1位女性，年齡介於60多歲至80多歲，有慢性肺疾、心血管疾病、高血壓等慢性病史，皆未接種COVID-19疫苗，皆於10/16死亡。（10/21疾管署判定公告）。
本縣接觸者居家隔離尚在追蹤中有686人，確診者輕症居家照護在管中有4,837人，醫療關懷諮詢累計已服務717,681人次。社團法人雲林縣藥師公會和社區藥局自4月25日至10月20日，持續提供居家照護送藥到府服務，並進行用藥指導，共計已服務5,120件。
衛生局呼籲，請鄉親千萬不要防疫疲乏，仍要持續遵守政府各項防疫措施，並維持個人衛生好習慣，勤洗手、戴口罩、完整接種疫苗、保持社交距離，減少不必要移動、活動或集會，避免出入人多擁擠場所或高感染傳播風險場域，出入公共場域落實手部消毒、體溫量測等相關措施，下載並使用「臺灣社交距離APP」，一起守護鄉親健康。